Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms