Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms