Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPOCK3Q9BQ16 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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