Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EME1Q96AY2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms