Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMYD1Q8NB12 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms