Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCD1Q6ZMY3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms