Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms