Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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