Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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TRAF1Q13077 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAF1Q13077 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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