Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PTPRJQ12913 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRJQ12913 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRJQ12913 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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