Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUCB1Q02818 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms