Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPIBQ01892 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms