Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4AP27815 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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