Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB6O95452 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB6O95452 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB6O95452 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms