Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDP1Q9P0J1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PDP1Q9P0J1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms