Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELL3Q9HB65 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELL3Q9HB65 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms