Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NTN4Q9HB63 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms