Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms