Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC149Q6ZUS6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms