Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms