Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IFT88Q13099 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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