Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCRN3Q0VDG4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms