Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms