Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms