Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OCA2Q04671 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms