Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms