Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNTAP49354 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms