Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms