Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3C2AO00443 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIK3C2AO00443 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms