Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms