Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLR1DQ9Y2S0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms