Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMM29Q9BSF4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms