Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms