Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms