Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RIF1Q5UIP0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms