Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTF1Q16619 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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