Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PCSK7Q16549 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCSK7Q16549 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms