Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F1Q01094 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms