Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms