Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOP08100 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHOP08100 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RHOP08100 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RHOP08100 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RHOP08100 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms