Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLIC3O95833 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms