Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP18Q9UMW8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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USP18Q9UMW8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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USP18Q9UMW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP18Q9UMW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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