Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMD3Q96D46 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms