Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMIGD2Q96BF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms