Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG9AQ7Z3C6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG9AQ7Z3C6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms