Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 TMPO-205ENST00000546828 564 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 30
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PRPF8Q6P2Q9 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 30
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PRPF8Q6P2Q9 ACTB-208ENST00000464611 715 ntTSL 56.34□□□□□ -1.391e-32■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 30
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PRPF8Q6P2Q9 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 30
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PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA1-202ENST00000374163 3202 ntTSL 28.52□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 30
PRPF8Q6P2Q9 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 30
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PRPF8Q6P2Q9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 29.9
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PRPF8Q6P2Q9 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 317.32■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 56.23□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.216e-8■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.846e-8■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 CELF1-219ENST00000539254 572 ntTSL 48.08□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 PIP5K1A-210ENST00000460157 554 ntTSL 47.41□□□□□ -1.222e-18■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 MAGI1-206ENST00000468159 972 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.227e-22■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 213.34□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 IMMP1L-203ENST00000527184 486 ntTSL 312.99□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 29.9
PRPF8Q6P2Q9 UNK-202ENST00000586527 1312 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 29.9
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