Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ETV1P50549 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms