Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP6P35125 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP6P35125 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP6P35125 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP6P35125 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP6P35125 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms