Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSDA5PKW4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms