Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMCC3Q9ULS5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMCC3Q9ULS5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms